Gıda güvenliğinde temizlik prosedürleriyle çözülemeyen sorunların çoğu tasarım kaynaklıdır: temizlenemeyen köşeler, ölü hatlar, uygun olmayan conta seçimi, drenaj eğimi olmayan zeminler ve zon ayrımı yapılmamış yerleşimler kalıcı mikrobiyolojik risk üretir. Hijyenik tasarım prensipleri bu riskleri ekipman satın alma ve tesis yatırımı aşamasında ortadan kaldırmayı hedefler; sonradan yapılan müdahaleler ise hem pahalı hem de sınırlı etkilidir. Bu nedenle hijyenik tasarım, kalite biriminin değil yatırım ve bakım kararlarının konusudur. Program altı modül boyunca hijyenik tasarım ilkeleri, malzeme ve yüzey kriterleri, ekipman detay tasarımı, tesis yerleşimi ve zon ayrımı, temizlenebilirlik doğrulaması ile satın alma şartnamesi başlıklarını işler. Atölyelerde gerçek ekipman fotoğrafları ve teknik çizimler üzerinden değerlendirme yapılır, saha denetimi simüle edilir. Katılımcılar program sonunda kendi tesisleri için hijyenik tasarım denetim raporu, öncelikli iyileştirme listesi ve ekipman satın alma şartnamesi taslağı üretir.