Jira Service Management, geliştirme ekipleriyle aynı platformda çalışabilme avantajı sayesinde birçok kurumda hizmet masasının doğal seçimi haline gelmiştir. Ancak varsayılan kurulumla başlayan projeler kısa sürede kontrolsüz büyür: onlarca talep tipi, birbirini tekrarlayan kuyruklar, kimsenin bakmadığı otomasyon kuralları ve raporlanamayan bir kayıt yığını ortaya çıkar. Doğru kurulum, proje ve şema mimarisinin baştan planlanmasını, talep tipi ile iş akışı arasındaki ilişkinin sade tutulmasını gerektirir. Bilgi tabanı, varlık yönetimi ve geliştirme projeleriyle kurulan bağlar ise platformun asıl değerini ortaya çıkarır. Program altı modül boyunca çalışan bir hizmet masası yapılandırmasını sıfırdan kurar. Katılımcılar portal talep tiplerini kullanıcı diliyle yazar, alan yapılandırma şemalarını kurar, iş akışı geçiş kurallarını tanımlar. SLA modülünde çalışma takvimi, hedef koşulları ve saat durdurma kuralları uygulamalı çalışılır. Otomasyon atölyesinde tekrarlayan işlemler için kural setleri oluşturulur ve kural çakışmaları test edilir. Assets modülünde varlık kayıtları talep formlarına bağlanır. Program sonunda katılımcı, yapılandırma kararlarını ve rapor tanımlarını içeren bir hizmet masası operasyon dosyası üretir.