AS9100, havacılık ve savunma sektöründe kalite yönetim sisteminin temel gerekliliklerine sektöre özgü ilaveler getirir; konfigürasyon yönetimi, ürün emniyeti, sahte parça önleme ve risk yönetimi bunların başında gelir. İç denetim, bu gerekliliklerin kağıt üzerinde değil sahada işlediğini gösteren en önemli iç kontrol mekanizmasıdır ve belgelendirme denetimlerinde kurumun olgunluğunun aynası sayılır. Zayıf bir iç denetim programı, dış denetimde büyük bulgular olarak geri döner. Program sekiz modülde standardın gereklilik yapısını çözümledikten sonra denetim planlama, yürütme ve raporlama becerilerini uygulamalı olarak geliştirir. Katılımcılar süreç bazlı kontrol listesi hazırlar, görüşme ve kanıt toplama tatbikatı yapar, bulgu yazımını karşılıklı değerlendirir. Program çıktısı olarak bir yıllık denetim programı, süreç kontrol listesi seti ve örnek denetim raporu hazırlanır.