Ar-Ge ve tasarım merkezi statüsü, personel sayısı, proje yapısı ve fiziki ayrım gibi şartlara bağlı olarak vergi indirimi, gelir vergisi stopajı teşviki ve sigorta primi desteği gibi güçlü avantajlar sağlar. Ancak avantajın sürdürülebilirliği, harcamaların doğru ayrıştırılması, dışarıda geçirilen sürelerin kurallara uygun izlenmesi ve yıllık faaliyet raporunun performansı gerçekten yansıtmasıyla mümkündür. Program, merkez yönetimini teşvik hesabı yapmaktan ibaret görmeyip proje dokümantasyonu, personel takibi ve denetim hazırlığını bütünleşik bir işletim düzeni olarak ele alır. Altı modül, başvuru dosyasından denetim ve performans değerlendirmesine uzanır. Katılımcılar proje tanımlama ve Ar-Ge niteliği değerlendirme çalışmaları yapar, harcama ayrıştırma ve stopaj teşviki hesaplama uygulamaları yürütür, yıllık faaliyet raporu ile izleme heyeti ziyaretine hazırlık atölyelerine katılır. Program sonunda her katılımcı kendi merkezi için bir uygunluk kontrol listesi, proje dokümantasyon standardı ve denetim hazırlık dosyası üretmiş olur.