AB fonlu projelerde uyum, ulusal desteklerden daha katı bir belge ve süreç disiplini gerektirir: satın almalarda ihale kuralları, görünürlük yükümlülükleri, ortaklık anlaşmaları ve raporlama formatları sözleşmenin ayrılmaz parçasıdır. Denetimlerde en sık karşılaşılan bulgular ise usulsüz satın alma, yetersiz zaman kaydı ve destekleyici belge eksikliğidir; bunların sonucu doğrudan mali düzeltme, yani harcamanın uygun görülmemesidir. Program, AB projesi yönetimini proje faaliyetlerinin ötesinde bir uyum işi olarak konumlandırır. Altı modül, hibe sözleşmesinden proje kapanışına kadar hattı kapsar. Katılımcılar sözleşme ve eklerinden yükümlülük çıkarımı yapar, satın alma dosyası kurgular, ortaklık anlaşması ve ortak yönetimi konularını çalışır; zaman kaydı, görünürlük ve raporlama uygulamaları yürütür. Program sonunda her katılımcı kendi projesi için bir uyum kontrol listesi, satın alma dosya standardı ve denetim izi düzeni üretmiş olur.